задачи на с++ структуры

Разработанные алгоритмы могут быть использованы для решения задачи прогнозирования взаимодействий белков на основе известных интерфейсов белковых комплексов. Экспериментальное определение пространственных структур комплексов белков является более сложной задачей, чем определение структуры индивидуального белка. Известно, что в большинстве случаев белковые комплексы, а не индивидуальные белк

Разработан подход сравнения математических моделей трехмерных структур белков и предсказания взаимодействия белков по их третичным структурам. Сравнение третичных структур белков основано на поиске преобразования движения, максимизирующего функцию сходства белков. Предсказание взаимодействия белков А и В состоит в поиске белковых комплексов А’В таких, что белки А и В гомологичны белкам А и В в области интерфейсов белковых комплексов (Рис. 1). Для поиска схожих интерфейсов была использована база данных белковых интерфейсов, представленная в Интернет. Поиск пространственной схожести только в области интерфейса значительно уменьшает время вычисления и адекватно отражает природу белковых взаимодействий.

Понимание процессов взаимодействия белков является необходимым шагом для моделирования биохимических взаимодействий в живой клетке, а также является структурной основой создания лекарств. Информация о схожести пространственных структур белков в значительной степени облегчает предсказание функций неизвестных белков, она также необходима для определения отдаленных эволюционных связей.

Целью проекта является исследование и разработка алгоритма сравнения трехмерных точечных множеств различной мощности с целью его применения для определения сходства третичных структур белков. Исследование алгоритма предсказания взаимодействия белков на основе сравнения третичных структур гомологичных белков (задача взаимодействия белков – docking) и сравнения интерфейсов взаимодействия белковых комплексов.

и предсказания их взаимодействий”, 2008-2010 гг.

“Исследование задач сравнения третичных структур белков, как трехмерных точечных множеств,

Проект БРФФИ Ф08МС-012 (международный проект с Университетом Канзаса, США)

Исследование задач сравнения третичных структур белков, как трехмерных точечных множеств, и предсказания их взаимодействий

 >   > 

Для сотрудников ОИПИ

Новости института

Подписка на рассылку

Запомнить меня на этом компьютере

Исследование задач сравнения третичных структур белков, как трехмерных точечных множеств, и предсказания их взаимодействий